青海山洪灾害是由不同高度、不同坡度的山体上大量降雨所引发的高山洪峰。其中，青海玉树地区发生山洪灾害的原因是由于地震波及雨季造成的。塔尔寺沟谷的地质结构复杂，断层众多,地震引发了强烈的地质运动，岩石猛然崩塌，管辖范围内河道由此次的地质运动增加了规模，河道断面面积扩大让水流量增大，所以在暴雨到来的时候，山洪过程的峰值达到了历史最高点。
另一方面，青藏高原的坡度和高度都较大，雨水不易渗透，山体上的积水、雪水、雨水等便形成了青藏高原特有的高山流水体系，一旦遇到暴雨等极端气象，这些积水便会从山体上急流而下，形成山洪。而青藏高原气候特点也会影响山洪的发生。气温较低，水汽少，降雨量普遍较低等因素，都使得流水体系常干旱处逐渐扩大，加上青藏高原气候多变、复杂，雨量、水汽分布不均，这些都为山洪的形成和发展提供了条件。
